Er zijn 3 niveaus waarop de Broederuniteit bestuurd wordt.

1. Uniteit.
   • Wereldwijd op uniteitsniveau bestaan gedragsregels en uitgangspunten waaraan de provincies zelfstandig invulling geven.
2. Provincie.
   • Op provinciaal niveau wordt invulling gegeven aan de gedragsregels voor de Broederuniteit en de uitgangspunten worden aangepast aan de lokale omstandigheden. Een provincie kan om uiteenlopende redenen ontstaan.
     • Een provincie kan historisch gegroeid zijn (Europa, N Amerika, Groot Brittannië) maar ook gebaseerd zijn op geografische afstanden (Alaska), politieke-staatkundige (Afrika) overwegingen (erkenning als kerk in een land), opsplitsing vanwege omvang (Tanzania).
     • Door samenvoeging van eerdere splitsingen (Zuid Afrika).
     • De grote spreiding van een groot aantal kleine gemeenten kan aanleiding zijn voor het vormen van één provincie (Caraïben).
   • Misschien lijkt deze decentralisatie niet zo bijzonder in de 21^ste eeuw. Het bijzondere is dat deze decentralisatie in de Broederuniteit vanaf het begin niet genegeerd kon worden.
3. Gemeente.
   • De kleinste organisatorische eenheid is de gemeente. De gemeente acteert binnen de provinciale gedragsregels en uitgangspunten en kan die voor de plaatselijke omstandigheden interpreteren.

De Broederuniteit is een wereldwijde kerk. Zij bestaat uit lokale gemeenschappen, (in 2015) 19 provincies die zich op hoofdpunten aan de uniforme gedragsregels en uitgangspunten houden. Die gedragsregels en uitgangspunten worden iedere 7 jaar op de uniteitssynode geëvalueerd en geactualiseerd. Die uniteitssysnode is het hoogste bestuursorgaan van de Broederuniteit. In de periode tussen de synoden regelt het unity board het dagelijks bestuur.

Iedere uniteitsprovincie vaardigt slechts enkele deelnemers af naar de uniteitssynode, waardoor deze synode compact blijft. De aanwezige bisschoppen hebben alleen een adviserende en pastorale functie tijdens de uniteitsynode.

Het unity board bestaat uit afgevaardigden van de uniteitsprovincies. Iedere uniteitsprovincie belast een lid uit het eigen provinciaal bestuur met de vertegenwoordiging in het unity board. Ook de zendingsgebieden en zendingsprovincies zijn in het unity board vertegenwoordigd, zij het dat hun vertegenwoordigers geen beslissingsbevoegdheid hebben.

De Broederuniteit bestaat uit uniteitsprovincies, zendingsprovincies, zendingsgebieden en uniteitswerken.

Het hoogste bestuursorgaan op provinciaal nivo is de provinciale synode. Hij beroept het provinciaal bestuur en kiest de bisschoppen uit de kring van de presbyters.

De deelnemers aan de provinciale synode worden gekozen in de gemeenten.

Het mandaat van de deelnemers aan de provinciale synode is bijzonder in de Broederuniteit. Zij spreken niet namens hun gemeente. Van hen wordt verwacht dat zij op persoonlijke titel hun afwegingen maken. Dit betekent dat zij wel een bijzondere vertrouwenspositie binnen de gemeente moeten hebben. Binnen de gemeente hebben zij dan ook geen bestuurlijke functie, maar adviseren zij het plaatselijk bestuur.

Het provinciaal bestuur is belast met de dagelijkse gang van zaken in de provincie in de periode tussen de synoden. Het provinciaal bestuur onderhoudt de contacten namens de provincie binnen en buiten de Broederuniteit. Ook benoemt het provinciaal bestuur de medewerkers in het pastoraat en verifieert het de juistheid van de procedures voor de verkiezing van leden in de plaatselijke besturen en de procedures voor de financiéle gang van zaken in de gemeenten.

De huidige uniteitsprovincies zijn voor een belangrijk deel door historische en geografische redenen ontstaan of zij zijn gegroeid uit een zendingsprovincie, maar opsplitsing van uniteitsprovincies vindt ook plaats (bijv. Tanzania).

Een zendingsprovincie kan het best worden omschreven als een zendingsgebied op weg naar zelfstandigheid die op één of meerdere onderdelen ondersteund worden door de provincie die het zendingswerk in de zendingsprovincie is begonnen.

In een zendingsgebied worden missionaire activiteiten ontplooit vanuit één van de uniteitsprovincies. Een zendingsgebied kan uitgroeien tot een zendingsprovincie.

Uniteitswerken zijn ondernemingen in de Broederuniteit die de gehele Broederuniteit betreffen. Voorbeelden zijn het Uniteitsarchief in Hernhut en De Sternberg, een instelling voor kinderen met een geestelijke beperking in Ramallah (Westbank).

De gemeente wordt geleid door het plaatselijk bestuur, de oudstenraad. Dit bestuur behartigt de belangen van de gemeente binnen de uniteitsprovincie, in plaatselijke kerkelijke en maatschappelijke verbanden en naar de plaatselijke overheid. De uit de leden gekozen oudstenraad draagt de verantwoordelijkheid voor de zielzorg in de gemeente, met dien verstande dat zij in Europa de professionele zielzorg in vult met medewerkers die door het provinciaal bestuur zijn aangesteld.